L’RNA è un filamento di nucleotidi, copia omologa di un gene del DNA, quindi è molto più corto del DNA che contiene molti geni.
Lo zucchero dell’RNA è un ribosio, questo ha un ossidrile in posizione 2 che lo rende meno stabile del DNA.
3 basi azotate sono uguali a quelle DNA: adenina, guanina e citosina, la 4° base è una timina demetilata che si chiama uracile.
Per trascrivere l’RNA servono l’enzima l’RNA polimerasi, 4 nucleotidi ATP, GTP, CTP e UTP che trasportano in ordine l’adenina, la guanina, la citosina e l’uracile, e la presenza di ioni Mn++ e Mg++.
La trascrizione avviene dentro il nucleo, poi l’mRNA abbandona il nucleo per passare nel citoplasma ove svolge la sua funzione.
RNA polimerasi
Le RNA polimerasi sono enzimi.
Negli eucarioti ci sono diverse RNA polimerasi:
la polimerasi 2° trascrive l’RNA messaggero, la 1° trascrive l’RNA ribosomiale, la 3° trascrive l’RNA trasportatore, la 5° l’RNA mitocondriale, wiki.
RNA messaggero
L’ RNA messaggero o mRNA viene trascritto come un negativo di un gene del DNA.
All’inizio e alla fine dell’mRNA ci sono i codoni di start e di stop.
Il codone di start
Il codone d’inizio AUG specifica il primo aminoacido metionina sia nei procarioti che negli eucarioti.
Il codone di stop
L’inizio e il fine di un gene che codifica per una proteina è segnato da uno stop, un codone di stop composto da una tripletta di DNA non codificante che interrompe la duplicazione dell’mRNA.
Esistono 3 codoni di stop: UAG, UAA e UGA.
La maturazione dell’m-RNA
Dentro il nucleo cellulare il pre-m-RNA deve essere rivestito, capping, in posizione 5′. Il rivestimento lo attiva pe quando sarà a contatto col ribosoma. Il rivestimento è un nucleotide alterato: la 7-metil guanosina.
I cappuccio di 7-metil guanosina al residuo 5-terminale della catena consente all’m-RNA di uscire dal nucleo e sarà il punto di aggancio del t-RNA nei ribosomi.
RNA ribosomiale
Nel nucleolo, quindi all’interno del nucleo, 4 RNA ribosomiali si legano con delle proteine per formare i ribosomi.
Ribosomi
I ribosomi sono composti da due subunità: la 60s maggiore e la 40s minore.
La maggiore ha 3 molecole di RNA e 45 proteine, la minore ha 1 molecola di RNA e 33 proteine.
I ribosomi possono essere liberi nel citoplasma o agganciati al reticolo endoplasmatico o alla membrana nucleare.
I ribosomi liberi producono proteine che vengono utilizzate dalla cellula stessa, i ribosomi legati al reticolo endoplasmatico producono molecole che resteranno oppure usciranno dalla cellula. Usciranno per esocitosi, è il caso delle secrezioni. Nell’esocitosi la proteina da far uscire è contenuta entro una membrana, vescicola, che fondendosi con la membrana cellulare, viene escreta dalla cellula.
RNA trasportatore
L’RNA trasportatore è composto da meno di 100 nucleotidi. Il t-RNA ha 3 nucleotidi detti anticodone che riconoscono altri 3 nucleotidi detti codone sull’ mRNA. In un’altra sede del t-RNA è agganciato un aminoacido. Per ogni aminoacido c’è uno specifico RNA trasportatore. Per cui c’è il tRNA per la fenilalanina con AAG, il tRNA per la lisina con 3 uracili, ecc.
Il tRNA si lega a 2 fattori IF2, a loro volta legati a 2 molecole energetiche di GTP.
Ora mRNA e tRNA possono operare la traduzione, cioè la sintesi proteica vera e propria.